MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_78p

Total Repeats: 1476

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018879	GTAT	2	8	1655	1662	25 %	50 %	25 %	0 %	410678639
2	NC_018879	A	6	6	1723	1728	100 %	0 %	0 %	0 %	410678639
3	NC_018879	ATAA	2	8	1753	1760	75 %	25 %	0 %	0 %	410678639
4	NC_018879	A	6	6	1839	1844	100 %	0 %	0 %	0 %	410678639
5	NC_018879	TCT	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678639
6	NC_018879	TGA	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678639
7	NC_018879	GAAA	2	8	2112	2119	75 %	0 %	25 %	0 %	410678639
8	NC_018879	TGG	2	6	2271	2276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678639
9	NC_018879	ATA	2	6	2300	2305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678639
10	NC_018879	GAACA	2	10	2330	2339	60 %	0 %	20 %	20 %	410678639
11	NC_018879	GAA	2	6	2500	2505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678639
12	NC_018879	TCA	2	6	2553	2558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678639
13	NC_018879	AT	3	6	2770	2775	50 %	50 %	0 %	0 %	410678639
14	NC_018879	ACA	2	6	2802	2807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678639
15	NC_018879	AGA	2	6	2838	2843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678639
16	NC_018879	A	6	6	2851	2856	100 %	0 %	0 %	0 %	410678639
17	NC_018879	TA	3	6	2933	2938	50 %	50 %	0 %	0 %	410678639
18	NC_018879	GAA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678639
19	NC_018879	CAA	2	6	2957	2962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678640
20	NC_018879	AAC	2	6	2965	2970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678640
21	NC_018879	TTAAAA	2	12	2984	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678640
22	NC_018879	TAA	2	6	3037	3042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678640
23	NC_018879	ATTC	2	8	3113	3120	25 %	50 %	0 %	25 %	410678640
24	NC_018879	AGG	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678640
25	NC_018879	TGA	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678640
26	NC_018879	TAA	2	6	3193	3198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678640
27	NC_018879	ACA	2	6	3199	3204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678640
28	NC_018879	CAA	2	6	3239	3244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678640
29	NC_018879	GTG	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678640
30	NC_018879	AGC	3	9	3310	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678640
31	NC_018879	TTATT	2	10	3337	3346	20 %	80 %	0 %	0 %	410678640
32	NC_018879	TTA	2	6	3438	3443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678640
33	NC_018879	TGA	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678640
34	NC_018879	GGA	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678640
35	NC_018879	ATT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678640
36	NC_018879	GTA	2	6	3525	3530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678640
37	NC_018879	CAT	2	6	3620	3625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678640
38	NC_018879	GGT	2	6	3631	3636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410678640
39	NC_018879	TGAT	2	8	3688	3695	25 %	50 %	25 %	0 %	410678640
40	NC_018879	CAT	2	6	3811	3816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678641
41	NC_018879	AT	3	6	3843	3848	50 %	50 %	0 %	0 %	410678641
42	NC_018879	T	7	7	3910	3916	0 %	100 %	0 %	0 %	410678641
43	NC_018879	TAA	2	6	3918	3923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678641
44	NC_018879	GATT	2	8	3924	3931	25 %	50 %	25 %	0 %	410678641
45	NC_018879	TCA	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678641
46	NC_018879	A	7	7	3968	3974	100 %	0 %	0 %	0 %	410678641
47	NC_018879	CTT	2	6	3988	3993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678641
48	NC_018879	ATTT	2	8	4051	4058	25 %	75 %	0 %	0 %	410678641
49	NC_018879	TAC	2	6	4274	4279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678642
50	NC_018879	TTC	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678642
51	NC_018879	TAT	2	6	4356	4361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678642
52	NC_018879	TAA	2	6	4428	4433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678642
53	NC_018879	AAATA	2	10	4453	4462	80 %	20 %	0 %	0 %	410678642
54	NC_018879	TGA	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678643
55	NC_018879	T	6	6	4618	4623	0 %	100 %	0 %	0 %	410678643
56	NC_018879	AGTA	2	8	4679	4686	50 %	25 %	25 %	0 %	410678643
57	NC_018879	ACG	2	6	4739	4744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678643
58	NC_018879	TCA	2	6	4791	4796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678643
59	NC_018879	TAA	2	6	4822	4827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678643
60	NC_018879	AGC	2	6	4828	4833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410678643
61	NC_018879	ACA	2	6	4846	4851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678643
62	NC_018879	ACT	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678643
63	NC_018879	TCT	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678643
64	NC_018879	CGTATT	2	12	4928	4939	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	410678643
65	NC_018879	AGG	2	6	4996	5001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410678643
66	NC_018879	TTCATA	2	12	5064	5075	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	410678643
67	NC_018879	ACA	2	6	5089	5094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678643
68	NC_018879	TG	3	6	5115	5120	0 %	50 %	50 %	0 %	410678643
69	NC_018879	AT	3	6	5188	5193	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
70	NC_018879	CTA	2	6	5209	5214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678643
71	NC_018879	TC	3	6	5217	5222	0 %	50 %	0 %	50 %	410678643
72	NC_018879	AC	3	6	5235	5240	50 %	0 %	0 %	50 %	410678643
73	NC_018879	GTAT	2	8	5241	5248	25 %	50 %	25 %	0 %	410678643
74	NC_018879	A	7	7	5250	5256	100 %	0 %	0 %	0 %	410678643
75	NC_018879	ATT	2	6	5268	5273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678643
76	NC_018879	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678643
77	NC_018879	TA	3	6	5306	5311	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
78	NC_018879	AGAT	2	8	5313	5320	50 %	25 %	25 %	0 %	410678643
79	NC_018879	GAAT	2	8	5385	5392	50 %	25 %	25 %	0 %	410678643
80	NC_018879	AACAA	2	10	5428	5437	80 %	0 %	0 %	20 %	410678643
81	NC_018879	CAA	2	6	5441	5446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678643
82	NC_018879	A	7	7	5475	5481	100 %	0 %	0 %	0 %	410678643
83	NC_018879	GTA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678643
84	NC_018879	TA	3	6	5532	5537	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
85	NC_018879	TTTA	2	8	5614	5621	25 %	75 %	0 %	0 %	410678643
86	NC_018879	TCA	2	6	5647	5652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678643
87	NC_018879	ATTG	2	8	5701	5708	25 %	50 %	25 %	0 %	410678643
88	NC_018879	TTC	2	6	5722	5727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678643
89	NC_018879	CTC	2	6	5753	5758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410678643
90	NC_018879	GAA	2	6	5761	5766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678643
91	NC_018879	A	6	6	5765	5770	100 %	0 %	0 %	0 %	410678643
92	NC_018879	AT	4	8	5795	5802	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
93	NC_018879	TCT	3	9	5818	5826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678643
94	NC_018879	TCT	2	6	5887	5892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678643
95	NC_018879	A	7	7	5927	5933	100 %	0 %	0 %	0 %	410678643
96	NC_018879	AT	3	6	5943	5948	50 %	50 %	0 %	0 %	410678643
97	NC_018879	A	6	6	6064	6069	100 %	0 %	0 %	0 %	410678644
98	NC_018879	TAA	2	6	6178	6183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678644
99	NC_018879	TCA	2	6	6209	6214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678644
100	NC_018879	CA	3	6	6245	6250	50 %	0 %	0 %	50 %	410678644
101	NC_018879	TCA	2	6	6353	6358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678644
102	NC_018879	CTA	2	6	6405	6410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678644
103	NC_018879	CCTT	2	8	6419	6426	0 %	50 %	0 %	50 %	410678644
104	NC_018879	ATT	2	6	6461	6466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678644
105	NC_018879	ATT	3	9	6979	6987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678645
106	NC_018879	TAA	2	6	6990	6995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678645
107	NC_018879	T	7	7	7022	7028	0 %	100 %	0 %	0 %	410678645
108	NC_018879	TGA	2	6	7036	7041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678645
109	NC_018879	ATT	2	6	7042	7047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678645
110	NC_018879	AAG	2	6	7050	7055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410678645
111	NC_018879	A	6	6	7120	7125	100 %	0 %	0 %	0 %	410678645
112	NC_018879	AAAT	2	8	7146	7153	75 %	25 %	0 %	0 %	410678645
113	NC_018879	A	7	7	7158	7164	100 %	0 %	0 %	0 %	410678645
114	NC_018879	CTT	2	6	7242	7247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678645
115	NC_018879	TTC	2	6	7345	7350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678646
116	NC_018879	TAT	2	6	7426	7431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678646
117	NC_018879	ATT	2	6	7450	7455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678646
118	NC_018879	AT	3	6	7456	7461	50 %	50 %	0 %	0 %	410678646
119	NC_018879	TA	3	6	7497	7502	50 %	50 %	0 %	0 %	410678646
120	NC_018879	AAT	2	6	7589	7594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678646
121	NC_018879	AAAC	2	8	7618	7625	75 %	0 %	0 %	25 %	410678646
122	NC_018879	A	6	6	7631	7636	100 %	0 %	0 %	0 %	410678646
123	NC_018879	ATT	3	9	7815	7823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678647
124	NC_018879	CT	3	6	7844	7849	0 %	50 %	0 %	50 %	410678647
125	NC_018879	TTC	2	6	7877	7882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678647
126	NC_018879	T	6	6	7894	7899	0 %	100 %	0 %	0 %	410678647
127	NC_018879	TCT	2	6	7911	7916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678647
128	NC_018879	CTT	2	6	7944	7949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678647
129	NC_018879	ATC	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410678647
130	NC_018879	ATT	2	6	7979	7984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678647
131	NC_018879	AAT	2	6	8001	8006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678647
132	NC_018879	TCT	3	9	8025	8033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410678647
133	NC_018879	ATTG	2	8	8068	8075	25 %	50 %	25 %	0 %	410678647
134	NC_018879	ATA	2	6	8103	8108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410678647
135	NC_018879	ACTTTT	2	12	8178	8189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	410678647
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137	NC_018879	CAA	2	6	8422	8427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410678648
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401	NC_018879	GTA	2	6	20543	20548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678663
402	NC_018879	ATTT	2	8	20550	20557	25 %	75 %	0 %	0 %	410678663
403	NC_018879	GCT	2	6	20572	20577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410678663
404	NC_018879	AAAAG	2	10	20679	20688	80 %	0 %	20 %	0 %	410678663
405	NC_018879	GAT	2	6	20771	20776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410678663
406	NC_018879	ATTT	2	8	20924	20931	25 %	75 %	0 %	0 %	410678663
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412	NC_018879	ATT	2	6	21158	21163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678665
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421	NC_018879	ATT	2	6	21315	21320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410678665
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